Fathers Legacy er et noir-mysteriespil, hvor du spiller som en ung mand, hvis far er død under mistænkte forhold. Han var involveret i en hemmelig organisation kendt som agenturet. Og de kommer til dig i håb om, at de vil finde noget, din far har skjult før sin død. Du vil snart lære at du er i problemer, og ingen omkring dig kan stole på. Ikke engang hvis de er en varm dame i benet, der er klar til at gå ned på dig, mens du kigger ind i dine øjne for at få din tillid.