Zwitter und das Geheimnis fehlender Exemplare ist ein Spiel nach der Highschool, das sich auf die Geschichte eines jungen Mannes konzentriert, der eine Transformation durchmacht. Er hat viele Freundinnen und er möchte so sehr eines der Mädchen sein. Also beschließt er, sich in eine Sissy und dann in eine komplette Transfrau zu verwandeln. Die Macher des Spiels bemerkten die Beliebtheit dieser Charaktere und beschlossen, ein bisschen mehr mit der Geschichte zu spielen. Sie haben einige neue Wege hinzugefügt, auf denen Sie gehen können, darunter einige Mädchenfiguren, die Transformationen durchlaufen, um ein Mann zu werden.